遺傳中心法則會被改寫嗎？

　　近日來自美國印地安那大學伯明頓分校的幾位科學家對今年早些時候發表在國際頂級學術期刊《科學》(Science)上的一篇熱點關注

河南食品網訊：

　　近日來自美國印地安那大學伯明頓分校的幾位科學家對今年早些時候發表在國際頂級學術期刊《科學》(Science)上的一篇熱點關注研究論文提出了質疑。

　　這篇題為“Widespread RNA and DNA Sequence Differences in the Human Transcriptome”的研究論文是由美國賓夕法尼亞大學Vivian Cheung領導的一個研究小組發布的。這篇文章一經發布便引起了科學界的廣泛關注，成為5月Science雜志最受關注的研究論文之一。

　　在這篇文章中Cheung等稱她們在新研究中驚異地發現RNA與DNA序列之間存在廣泛的差異。研究人員對參與了千人基因組計劃(the 1000 Genomes Project)和國際單體型計劃(the International HapMap Project)的27個人的全基因組和轉錄組測序結果進行分析和比較后，發現大量的RNA與其模板DNA序列不一致，他們在外顯子中發現了超過1萬個不同的位點。由于在不同的人中存在有相同的錯配，從而表明這些并非是轉錄過程中的隨機錯誤。進而他們證實這些“錯配”的RNA也參與指導合成了蛋白質。

　　此外，研究人員在文章中還強調他們發現的RNA編輯現象是不同尋常的。平均每個人大約存在1065個這樣的RNA與DNA序列差異(RNA–DNA differences ，RDDs)。其中一些錯配的堿基改變并非通過已知的RNA編輯機制產生，這表明還存在其他未知的作用機制。

　　當時對這一研究進行報道和點評的新聞媒體指出：“這一研究如果被證實是真實的話，將成為本年度最重要的發現，從而導致分子生物學中的‘遺傳中心法則’被改寫。”

　　然而本月初美國印地安那大學伯明頓分校3位科學家Daniel R. Schrider, Jean-Francois Gout 和 Matthew W. Hahn發布了最新的研究數據，指出Cheung小組報道的約55%的RNA-DNA差異事實上是種內同源基因的準確轉錄(它們高度相似，卻不完全相同)，因而并不能算是RNA-DNA差異。Hahn稱這些種內同源基因的一些存在于人類參考序列中，還有一些存在于Cheung原始研究測序個體的基因組中。Hahn認為Cheung研究小組并未發現這些種內同源基因序列是因為她們沒有將轉錄RNA序列與研究中測序個體的DNA序列或是人類參考序列進行比對。此外，Hahn還指出Cheung的原始研究工作中可能還存在其他一些潛在的錯誤。

　　Cheung第一時間對Hahn等人的質疑提出了反駁，Cheung表示在論文發表后她們對更多的樣本進行了分析，并在分析中增添了更多的參數，新研究數據支持并進一步地驗證了她們初期的發現。此外，近幾個月來其他一些研究團體在權威期刊上發表的論文也與她們的數據相互印證。

　　Chueng表示：“來自Schrider及其同事的數據是不嚴謹的。”她認為Hahn和同事在參考序列中鑒別的許多種內同源基因并不存在于她的研究小組報告的RNA-DNA差異序列中，Hahn的研究小組沒有足夠的證據證實90%的RNA-DNA差異都是假象。

　　Hahn對Chueng的說法進行了回復。Hahn稱他的研究小組發現了數千個種內同源基因與報告的在人參考序列及檢測個體基因組中的RNA-DNA差異相匹配。90%的差異是錯誤的結論是對已有數據的合理推測。

　　Hahn還指出另一位科學家Heng Li在將來自于Cheung研究的一個個體的RNA-DNA差異與個人的全基因組測序序列進行了比較后，發現Cheung'小組報告的1244個RNA-DNA錯配事實上不到50個。并且大多數差異與從前已知的RNA編輯方式相一致。

　　Hahn指出在DNA的轉錄物中存在個別的RNA編輯現象，這一機制從未遭受過質疑。其爭議所在是存在有1萬個RNA-DNA差異，還是只是存在多個不同的位點。Hahn認為Cheung沒有資格將研究成果發表在Science雜志上，因為她發現的RNA編輯并非她們所聲稱是一種不同尋常的機制。盡管Cheung引用了大量的論文來支持她的研究，Hahn仍認為Cheung利用這些論文來支持她的觀點不過是一種狡辯。(來源：生物通)