蒺藜苜蓿microRNA的全基因組鑒定最新進展 —— 新聞詳情

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蒺藜苜蓿microRNA的全基因組鑒定最新進展

2011-10-10 01:42

　　南京農業大學生命科學學院楊志敏教授領銜的團隊在Plant Cell Environ最新9月刊上發表了有關蒺藜苜蓿microRNA的論文Genome-

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　　南京農業大學生命科學學院楊志敏教授領銜的團隊在Plant Cell Environ最新9月刊上發表了有關蒺藜苜蓿microRNA的論文Genome-wide identification of Medicago truncatula microRNAs and their targets reveals their differential regulation by heavy metal。該研究鑒定了蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)中的新microRNA(miRNA)，并研究了miRNA的完整表達譜和復雜度，以及它們所對應的靶標。

　　研究人員設置了蒺藜苜蓿種子汞處理組和無汞對照組，以此建立了2個small RNA文庫和2個降解組文庫，并進行Illumina高通量測序。每個文庫獲取了約1千萬的測序讀數。

　　研究人員發現了至少52條長度約為21個核苷酸的候選新miRNA與蒺藜苜蓿的基因組完全匹配。同時，發現201條miRNA代表63個已知的蒺藜苜蓿miRNA家族，包括尚未有過描述的12個保守miRNA和1個非保守miRNA。之后，研究人員利用高通量降解組測序策略鑒定出58個已知(37個保守和21個非保守)miRNA家族對應的130個靶標和18個新發現蒺藜苜蓿特有的候選miRNA家族對應的37個靶標。

　　(河南食品網翻譯中心周航)

　　原文鏈接： Genome-wide identification of Medicago truncatula microRNAs and their targets reveals their differential regulation by heavy metal(Abstract)

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